Ciało dyktatora spoczywało w mauzoleum w Dolinie Poległych, gdzie zostało pochowanych kilkadziesiąt tysięcy ofiar hiszpańskiej wojny domowej w 1936 r. W krypcie odbyła się prywatna msza, w której wzięło udział tylko 22 krewnych dyktatora i garstka urzędników.
Lewicowy rząd Hiszpanii podjął decyzję o przeniesieniu szczątków generała z mauzoleum, jednak spotkał się z protestami zwolenników Franco, skrajnej prawicy i rodziny byłego przywódcy kraju. Ostateczną decyzję w tej sprawie podjął hiszpański Sąd Najwyższy. Zdaniem Francisca Franco Martinez-Bordiu, była ona „złamaniem wszelkich praw międzynarodowych”.
Francisco Franco zmarł 20 listopada 1975 roku. Sprawował w Hiszpanii władzę dyktatorską od zakończenia wojny domowej (1936-1939) do śmierci.