Do ataku doszło 9 października 2019 roku. Napastnik najpierw przerzucił ładunki wybuchowe przez mur okalający teren synagogi w Halle, a następnie próbował wedrzeć się do świątyni, w której przebywało ponad 50 wiernych, obchodzących Jom Kippur. Gdy nie udało mu się wejść do środka Stephan B. zastrzelił dwie przypadkowe osoby oraz ranił wiele innych, po czym został złapany.
Zabójca filmował swoje czyny i transmitował je na żywo w sieci.